Se localiza en el territorio correspondiente a la Provincia Mariscal Caceres-Juanjui, dentro de Parque Nacional Rio Abiseo, en la jurisdicción del distrito Huicungo, en la margen derecha del rio Montecristo. Fue declarado Patrimonio Natural y Cultural de la Humanidad por la UNESCO en 1991 y 1992 respectivamente.

Este lugar está formado por calles serpenteadas y plataformas empedradas donde se localizan edificaciones circulares, adornadas por representaciones antropomorfas, zoomorfas y geométricas magníficamente trabajadas con piedra volcánica o laja.

El recinto está cubierto por una espesa vegetación, que lo oculta en un escenario agreste, enigmático y misterioso.

Las edificaciones se extienden sobre los flancos de una angosta meseta y llegan en su parte más baja hasta el sector denominado las palmas, existiendo otros asentamientos en cerros del entorno, todos cubiertos por la enmarañada floresta.

No se tiene certeza científica a que cultura pertenece pero, por su patrón arquitectónico y diseño, muchos expertos coinciden que procederían de la cultura Chachapoyas (1200 a 1500 dc).

El gran Pajaten sigue siendo un misterio puesto que según los estudios realizados por la Universidad Colorado Boulder, y el uso del Carbono 14, tiene una antigüedad de 8 a 12 000 a.c.

A una hora de la ciudadela de El Gran Pajatén y a 20 minutos a pie desde el Campamento Macedonio, se encuentra un conjunto de edificaciones funerarias conocidos como el Mausoleo o Santuario de Los Pinchudos, situado a 2.800 msnm. Está compuesto por 6 edificios circulares, construidos sobre un balcón geológico en medio de un gran peñasco. En este lugar se observan frisos policromos y esculturas zoomorfas, colgantes tallados en madera de 70 centímetros. El diseño enigmático de hombres resaltando la erección de sus genitales, dieron origen a su nombre; "Los Pinchudos". Por encontrarse próximo al Departamento de La Libertad, el acceso más directo es por Trujillo (30 minutos en avioneta) hasta la localidad de Chagual; desde allí 40 km (2 horas en auto) hasta la localidad de Pataz. Luego se continúa por un camino de herradura de 15 km (30 minutos en auto y a 2 horas y 30 minutos a pie o en mula) hasta Chigualén, posteriormente, se recorren 35 km a pie o en mula (9 horas) hasta Puerta del Monte. De este punto al lugar llamado La Playa, son 10 km más (3 horas a pie) y desde La Playa hay que caminar 3 horas hasta el Campamento Macedonio. Desde aquí son 2 horas más de caminata para acceder al sitio arqueológico.

Sólo es posible acceder al Gran Pajatén en expediciones previamente autorizadas dirigidos a la investigación. No existe aún acceso turístico. En la actualidad, se están abriendo proyectos de crear una ruta turística que haga el trayecto: Juanjuí-Ochanache-El Gran Pajatén.

La estación recomendada para visitar el Complejo de El Gran Pajatén es en época de verano, de Mayo a Noviembre.